В рамках ЕС выстроена многоуровневая система защиты активов владельцев акций ETF, ключевым элементом которой выступает кастодиан, который осуществляет ответственное хранение всех активов фонда, а также совместно с администратором контролирует действия менеджера в части точного следования инвестиционной декларации фонда (заявленному индексу и способу его репликации). При этом кастодиан (депозитарий) не просто выполняет свои контрактные обязательства перед фондом и его инвесторами, но и за качество своей работы (обеспечение сохранности активов фонда) отвечает всем своим имуществом.

Для фондов FinEx ETF кастодианом и администратором выступает крупнейший в мире депозитарный банк — Bank of New York Mellon (BNY Mellon), на хранении у которого находятся активы на сумму более 35 трлн долл. США. Это обеспечивает высочайшую надежность и качество услуг, а гарантией защиты инвесторов является ответственность BoNY Mellon всем своим собственным имуществом за сохранность и соответствие активов FinEx ETF заявленной инвестиционной политике.